Norr anklagas för att ligga bakom attackerna.
Området har den senaste tiden präglats av våld och sammanstötningar som eskalerat sedan det blev klart att Södra Sudan väntas bli självständigt redan den 9 juli i år.
Philip Aguer, talesman för Södra Sudans militär, anklagare norra Sudans ledning för att beväpna milisgrupper som beordras attackera sydsudaneser, allt för att skapa oro i regionen.
Något som representanter för norra Sudan hela tiden förnekat, uppger Reuters Africa.
