Hade bensindunk och kniv med sig in på ambassaden.
Mannen tog två personer som gisslan. De fritogs dock så småningom och mannen sköts ned.
Enligt BBC rör det sig om samme man, Nadim Injaz, som stormade den brittiska ambassaden i Tel Aviv 2006.
Ingen annan skadades vid gisslandramat.
– En man som påstod sig vara palestinier kom till ambassaden och ville ha asyl. Han uppges ha varit beväpnad men övermannades, säger Turkiets utrikesminister Ahmet Davutoglu till BBC.
Enligt Davutoglu ska mannen ha haft med sig en kniv, en bensindunk och en låtsaspistol in på ambassaden. Mannen uppges, trots att han skjutits, vara vid "god hälsa".
